基因中map和read是什么意思RPKM是将map到基因的read数除以map到genome的所有read数(以million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。这个概念怎也理解不了

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/10 10:36:19
基因中map和read是什么意思RPKM是将map到基因的read数除以map到genome的所有read数(以million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。这个概念怎也理解不了

基因中map和read是什么意思RPKM是将map到基因的read数除以map到genome的所有read数(以million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。这个概念怎也理解不了
基因中map和read是什么意思
RPKM是将map到基因的read数除以map到genome的所有read数(以million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。这个概念怎也理解不了

基因中map和read是什么意思RPKM是将map到基因的read数除以map到genome的所有read数(以million为单位)与RNA的长度(以KB为单位)。这个概念怎也理解不了
此处,map的意思是“比对到基因图上”;read是指测序出的一条序列,也称“读序”.
正在做RNA seq?
RPKM,Reads Per Kb per Million reads
RPKM=(10的9次方×C)/(N×L).RPKM为某基因的表达量,C为唯一比对到该基因的reads数,N为唯一比对到参考基因的总reads数,L为该基因编码区的碱基数.RPKM法能消除基因长度和测序量差异对计算基因表达的影响,计算得到的基因表达量可直接用于比较不同样品间的基因表达差异.

map是染色体图,遗传图(染色体上基因的排列)
read是解读(遗传密码),解(码);译出(遗传信息)